MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 2683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018626	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018626	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018626	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018626	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018626	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018626	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018626	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018626	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018626	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018626	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018626	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018626	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018626	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018626	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018626	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018626	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018626	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018626	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018626	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018626	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018626	TCC	2	6	18549	18554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018626	GTT	2	6	20324	20329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018626	TCC	2	6	20330	20335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018626	TTA	2	6	20340	20345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018626	T	6	6	20379	20384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018626	TCT	2	6	20388	20393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018626	AAT	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018626	TAA	2	6	21724	21729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018626	T	9	9	21771	21779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018626	TAA	2	6	21788	21793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018626	T	6	6	21811	21816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018626	TTC	2	6	23790	23795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018626	T	7	7	23804	23810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018626	A	7	7	23888	23894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018626	AGA	2	6	23904	23909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018626	ATT	2	6	26538	26543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018626	T	7	7	26581	26587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018626	A	6	6	30339	30344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018626	TTTC	2	8	31651	31658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018626	AGG	2	6	31745	31750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018626	T	6	6	31769	31774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018626	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018626	AGA	2	6	31967	31972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018626	CTT	2	6	31982	31987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018626	TCTA	2	8	32054	32061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018626	A	6	6	32363	32368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018626	AATT	2	8	32378	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018626	AAT	2	6	32407	32412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018626	TTAA	2	8	32418	32425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018626	TTA	2	6	33428	33433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018626	AAG	2	6	33449	33454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018626	A	6	6	33505	33510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018626	TTAA	2	8	33514	33521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018626	TGT	3	9	33528	33536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018626	AGAT	2	8	33557	33564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018626	AAG	2	6	33573	33578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018626	ATTTAA	2	12	33596	33607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018626	TGG	2	6	34230	34235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018626	ATAAA	2	10	34285	34294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018626	A	6	6	34302	34307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018626	TTC	2	6	37589	37594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018626	TTC	2	6	37630	37635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018626	TGC	2	6	37678	37683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018626	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018626	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018626	AGA	2	6	37868	37873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018626	TAT	2	6	38103	38108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018626	GAA	2	6	39479	39484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018626	TTA	2	6	42385	42390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018626	GAA	2	6	42407	42412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018626	AGT	2	6	42696	42701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018626	TTTTAA	2	12	42719	42730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018626	CAA	2	6	42771	42776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018626	A	6	6	43436	43441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018626	GTT	2	6	43448	43453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018626	AAGA	2	8	48053	48060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018626	TA	3	6	52214	52219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018626	GAT	2	6	52230	52235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018626	TCG	2	6	52297	52302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018626	TTG	2	6	52312	52317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018626	T	6	6	52328	52333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018626	T	8	8	52363	52370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018626	GTC	2	6	52416	52421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018626	A	6	6	52452	52457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018626	TTTTG	2	10	52487	52496	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018626	AAG	2	6	52516	52521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018626	AAAG	2	8	52611	52618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018626	TTTA	2	8	52621	52628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018626	A	6	6	54479	54484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018626	T	7	7	54504	54510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018626	AAT	2	6	54532	54537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018626	TGG	2	6	57863	57868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018626	TTAAT	2	10	57967	57976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018626	GGT	2	6	58092	58097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018626	A	8	8	58101	58108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018626	TCTTT	2	10	59381	59390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018626	GGC	2	6	59420	59425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018626	GAG	2	6	59479	59484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018626	ATT	2	6	59528	59533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018626	TTA	2	6	59555	59560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018626	A	6	6	59577	59582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018626	TAA	2	6	59629	59634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018626	AGA	2	6	59705	59710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018626	GTTT	2	8	59864	59871	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018626	CTA	2	6	59943	59948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018626	CAA	2	6	63267	63272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018626	TG	3	6	63276	63281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018626	TTG	2	6	64348	64353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018626	A	7	7	64358	64364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018626	GAA	2	6	64375	64380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018626	TCC	2	6	64460	64465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018626	CTTT	2	8	64538	64545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018626	AAT	2	6	64606	64611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018626	TGT	2	6	66122	66127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018626	ATT	2	6	66147	66152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018626	T	7	7	71042	71048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018626	A	7	7	71092	71098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018626	CACTT	2	10	71100	71109	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018626	ATA	2	6	71208	71213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018626	T	6	6	72093	72098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018626	TTA	3	9	74060	74068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018626	ATC	2	6	76057	76062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018626	TCA	2	6	77382	77387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018626	ACA	3	9	77439	77447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018626	TTC	2	6	77459	77464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018626	TAT	2	6	77490	77495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018626	TAAT	2	8	77630	77637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018626	TATT	2	8	77647	77654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018626	TTAA	2	8	77656	77663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018626	TAAA	2	8	77687	77694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018626	ATTA	2	8	77704	77711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018626	AATTT	2	10	77712	77721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018626	ATTATA	2	12	77726	77737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018626	TAT	2	6	77749	77754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018626	AGA	2	6	80462	80467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018626	TAAA	2	8	80468	80475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018626	AAT	2	6	80558	80563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018626	T	6	6	81769	81774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018626	TGT	2	6	81779	81784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018626	T	7	7	81826	81832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018626	T	6	6	81842	81847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018626	CAA	2	6	81865	81870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018626	TCC	2	6	81880	81885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_018626	GTA	2	6	83287	83292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018626	TCC	2	6	83314	83319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018626	TTA	2	6	83393	83398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018626	AAT	2	6	83400	83405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018626	AGT	2	6	83413	83418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018626	AAAG	2	8	83449	83456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018626	ATC	2	6	84761	84766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_018626	AGAAA	2	10	87322	87331	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018626	GTT	2	6	87351	87356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_018626	T	7	7	87400	87406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_018626	T	6	6	108263	108268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_018626	ATT	2	6	147571	147576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018626	T	6	6	147581	147586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_018626	T	6	6	211859	211864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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